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blastx是什么？

blast全称是Basic Local Alignment Search Tool，是一种基于序列比对而判断核酸或蛋白的算法。 当你获得了一段DNA序列（或者mRNA序列、蛋白序列等），却不知道它属于哪段基因、有什么作用，就可以尝试用blast，从已知的基因库中找出序列相同或者最相似的基因。 blast有许多不同的子集，比如输入核酸序列寻找核酸的blastn，输入蛋白序列寻找蛋白的blastp。 blastx也是其中一个。 用blastx你可以输入DNA序列，寻找蛋白。 未知的DNA序列可能是正义链也可能是反义链，读码框也有各3种可能，一共是6种可能。 blastx会帮你把这一段序列的6种可能全部翻译成蛋白，分别从库中查找一遍，然后寻找最相似的几个返回结果。

冬天植物的光合作用

光合作用可分为光反应和暗反应（又叫碳反应）两个阶段。 2.1 光反应条件：光照、光合色素、光反应酶。 场所：叶绿体的类囊体薄膜。 过程：①水的光解：2H2O→4[H]+O2↑(在光和叶绿体中的色素的催化下）。 ②ATP的合成：ADP+Pi→ATP（在光、酶和叶绿体中的色素的催化下）。 影响因素：光照强度、CO2浓度、水分供给、温度、酸碱度等。 意义：①光解水，产生氧气。 ②将光能转变成化学能，产生ATP，为暗反应提供能量。 ③利用水光解的产物氢离子，合成NADPH，为暗反应提供还原剂NADPH。 2.2 暗反应暗反应的实质是一系列的酶促反应。 条件：暗反应酶。 场所：叶绿体基质。 影响因素：温度、CO2浓度、酸碱度等。 过程：不同的植物，暗反应的过程不一样，而且叶片的解剖结构也不相同。 这是植物对环境的适应的结果。 暗反应可分为C3、C4和CAM三种类型。 三种类型是因二氧化碳的固定这一过程的不同而划分的。 对于最常见的C3的反应类型，植物通过气孔将CO2由外界吸入细胞内，通过自由扩散进入叶绿体。 叶绿体中含有C5。 起到将CO2固定成为C3的作用。 C3再与NADPH及ATP提供的能量反应，生成糖类（CH2O）并还原出C5。 被还原出的C5继续参与暗反应。 光合作用的实质是把CO2和H2O转变为有机物（物质变化）和把光能转变成ATP中活跃的化学能再转变成有机物中的稳定的化学能（能量变化）。 [编辑本段]3. 光合作用的详细机制植物利用阳光的能量，将二氧化碳转换成淀粉，以供植物及动物作为食物的来源。 叶绿体由于是植物进行光合作用的地方，因此叶绿体可以说是阳光传递生命的媒介。 3.1 原理 植物与动物不同，它们没有消化系统，因此它们必须依靠其他的方式来进行对营养的摄取。 就是所谓的自养生物。 对于绿色植物来说，在阳光充足的白天，它们将利用阳光的能量来进行光合作用，以获得生长发育必需的养分。 这个过程的关键参与者是内部的叶绿体。 叶绿体在阳光的作用下，把经有气孔进入叶子内部的二氧化碳和由根部吸收的水转变成为淀粉，同时释放氧气3.2 注意事项上式中等号两边的水不能抵消，虽然在化学上式子显得很特别。 原因是左边的水，是植物吸收所得，而且用于制造氧气和提供电子和氢离子。 而右边的水分子的氧原子则是来自二氧化碳。 为了更清楚地表达这一原料产物起始过程，人们更习惯在等号左右两边都写上水分子，或者在右边的水分子右上角打上星号。 3.3 光反应和暗反应请参见本词条的“基本原理”栏目。 3.4 吸收峰 叶绿素a,b的吸收峰叶绿素a、b的吸收峰过程：叶绿体膜上的两套光合作用系统：光合作用系统一和光合作用系统二，（光合作用系统一比光合作用系统二要原始，但电子传递先在光合系统二开始）在光照的情况下，分别吸收680nm和700nm波长的光子（以蓝紫光为主，伴有少量红色光），作为能量，将从水分子光解过程中得到电子不断传递，（能传递电子得仅有少数特殊状态下的叶绿素a) 最后传递给 辅酶二 NADP+。 而水光解所得的氢离子则因为顺浓度差通过类囊体膜上的蛋白质复合体从类囊体内向外移动到基质，势能降低，其间的势能用于合成ATP，以供暗反应所用。 而此时势能已降低的氢离子则被氢载体NADP+带走。 一分子NADP+可携带两个氢离子,NADP +2e- +H+ =NADPH .还原性辅酶二 DANPH则在暗反应里面充当还原剂的作用。 3.5 有关化学方程式H20→2H+ 1/2O2（水的光解） NADP+ + 2e- + H+ → NADPH（递氢） ADP+Pi→ATP （递能） CO2+C5化合物→2C3化合物（二氧化碳的固定） 2C3化合物→（CH2O）+ C5化合物（有机物的生成或称为C3的还原）ATP→ADP+PI（耗能）能量转化过程：光能→不稳定的化学能（能量储存在ATP的高能磷酸键）→稳定的化学能（糖类即淀粉的合成）注意：光反应只有在光照条件下进行，而只要在满足暗反应条件的情况下暗反应都可以进行。 也就是说暗反应不一定要在黑暗条件下进行。 3.6 光反应阶段和暗反应阶段的关系①联系：光反应和暗反应是一个整体，二者紧密联系。 光反应是暗反应的基础，光反应阶段为暗反应阶段提供能量（ATP）和还原剂（【H】），暗反应产生的ADP和Pi为光反应合成ATP提供原料。 ②区别：（见下表） 项目光反应暗反应 实质光能→ 化学能，释放O2同化CO2形成（CH2O)（酶促反应）时间短促，以微秒计较缓慢 条件需色素、光和酶不需色素和光，需多种酶场所在叶绿体内囊状结构薄膜上进行在叶绿体基质中进行物质转化2H2O→4[H]+O2↑(在光和叶绿体中的色素的催化下） ADP+Pi→ATP（在光、酶和叶绿体中的色素的催化下）CO2+C5→2C3（在酶的催化下）C3+【H】→（CH2O）+ C5（在酶和ATP的催化下）能量转化叶绿素把光能转化为活跃的化学能并储存在ATP中ATP中活跃的化学能转化变为糖类等有机物中稳定的化学能[编辑本段]4. 光合作用的要点解析 4.1 光合色素和电子传递链组分4.3 光合磷酸化一对电子从P680经P700传至NADP+，在类囊体腔中增加4个H+，2个来源于H2O光解，2个由PQ从基质转移而来，在基质外一个H+又被用于还原 NADP+，所以类囊体腔内有较高的H+（pH≈5，基质pH≈8），形成质子动力势，H+经ATP合酶，渗入基质、推动ADP和Pi结合形成ATP。 ATP合酶，即CF1-F0偶联因子，结构类似于线粒体ATP合酶。 CF1同样由5种亚基组成α3β3γδε的结构。 CF0嵌在膜中，由4种亚基构成，是质子通过类囊体膜的通道。 4.4 卡尔文原理卡尔文循环（Calvin Cycle）是光合作用的暗反应的一部分。 反应场所为叶绿体内的基质。 循环可分为三个阶段: 羧化、还原和二磷酸核酮糖的再生。 大部分植物会将吸收到的一分子二氧化碳通过一种叫二磷酸核酮糖羧化酶的作用整合到一个五碳糖分子1，5-二磷酸核酮糖（RuBP）的第二位碳原子上。 此过程称为二氧化碳的固定。 这一步反应的意义是，把原本并不活泼的二氧化碳分子活化，使之随后能被还原。 但这种六碳化合物极不稳定，会立刻分解为两分子的三碳化合物3-磷酸甘油酸。 后者被在光反应中生成的NADPH+H还原，此过程需要消耗ATP。 产物是3-磷酸丙糖。 后来经过一系列复杂的生化反应，一个碳原子将会被用于合成葡萄糖而离开循环。 剩下的五个碳原子经一些列变化，最后在生成一个1，5-二磷酸核酮糖，循环重新开始。 循环运行六次，生成一分子的葡萄糖。 4.4.1 C3类植物 二战之后，美国加州大学贝克利分校的马尔文·卡尔文与他的同事们研究一种名叫Chlorella的藻，以确定植物在光合作用中如何固定CO2。 此时C14示踪技术和双向纸层析法技术都已经成熟，卡尔文正好在实验中用上此两种技术。 他们将培养出来的藻放置在含有未标记CO2的密闭容器中，然后将C14标记的CO2注入容器，培养相当短的时间之后，将藻浸入热的乙醇中杀死细胞，使细胞中的酶变性而失效。 接着他们提取到溶液里的分子。 然后将提取物应用双向纸层析法分离各种化合物，再通过放射自显影分析放射性上面的斑点，并与已知化学成份进行比较。 卡尔文在实验中发现，标记有C14的CO2很快就能转变成有机物。 在几秒钟之内,层析纸上就出现放射性的斑点,经与一直化学物比较，斑点中的化学成份是三磷酸甘油酸（3-phosphoglycerate，PGA），是糖酵解的中间体。 这第一个被提取到的产物是一个三碳分子， 所以将这种CO2固定途径称为C3途径,将通过这种途径固定CO2的植物称为C3植物。 后来研究还发现，CO2固定的C3途径是一个循环过程,人们称之为C3循环。 这一循环又称卡尔文循环。 C3类植物，如米和麦，二氧化碳经气孔进入叶片后，直接进入叶肉进行卡尔文循环。 而C3植物的维管束鞘细胞很小，不含或含很少叶绿体，卡尔文循环不在这里发生。 4.4.2 C4类植物 在20世纪60年代，澳大利亚科学家哈奇和斯莱克发现玉米、甘蔗等热带绿色植物，除了和其他绿色植物一样具有卡尔文循环外，CO2首先通过一条特别的途径被固定。 这条途径也被称为哈奇-斯莱克途径。 C4植物主要是那些生活在干旱热带地区的植物。 在这种环境中，植物若长时间开放气孔吸收二氧化碳，会导致水分通过蒸腾作用过快的流失。 所以，植物只能短时间开放气孔，二氧化碳的摄入量必然少。 植物必须利用这少量的二氧化碳进行光合作用，合成自身生长所需的物质。 在C4植物叶片维管束的周围，有维管束鞘围绕，这些维管束鞘细胞含有叶绿体，但里面并无基粒或发育不良。 在这里，主要进行卡尔文循环。 其叶肉细胞中，含有独特的酶，即磷酸烯醇式丙酮酸碳氧化酶，使得二氧化碳先被一种三碳化合物--磷酸烯醇式丙酮酸同化，形成四碳化合物草酰乙酸，这也是该暗反应类型名称的由来。 这草酰乙酸在转变为苹果酸盐后,进入维管束鞘，就会分解释放二氧化碳和一分子丙酮酸。 二氧化碳进入卡尔文循环，后同C3进程。 而丙酮酸则会被再次合成磷酸烯醇式丙酮酸,此过程消耗ATP。 也就是说，C4植物可以在夜晚或气温较低时开放气孔吸收CO2并合成C4化合物，再在白天有阳光时借助C4化合物提供的CO2合成有机物。 该类型的优点是，二氧化碳固定效率比C3高很多,有利于植物在干旱环境生长。 C3植物行光合作用所得的淀粉会贮存在叶肉细胞中，因为这是卡尔文循环的场所，而维管束鞘细胞则不含叶绿体。 而C4植物的淀粉将会贮存于维管束鞘细胞内，因为C4植物的卡尔文循环是在此发生的。 4.4.3 景天酸代谢植物 景天酸代谢（crassulacean acid metabolism, CAM）： 如果说C4植物是空间上错开二氧化碳的固定和卡尔文循环的话，那景天酸循环就是时间上错开这两者。 行使这一途径的植物，是那些有着膨大肉质叶子的植物，如凤梨。 这些植物晚上开放气孔，吸收二氧化碳，同样经哈奇-斯莱克途径将CO2固定。 早上的时候气孔关闭，避免水分流失过快。 同时在叶肉细胞中开尔文循环开始。 这些植物二氧化碳的固定效率也很高。 4.4.4 藻类和细菌的光合作用 绿藻真核藻类，如红藻、绿藻、褐藻等，和植物一样具有叶绿体，也能够进行产氧光合作用。 光被叶绿素吸收，而很多藻类的叶绿体中还具有其它不同的色素，赋予了它们不同的颜色。 进行光合作用的细菌不具有叶绿体，而直接由细胞本身进行。 属于原核生物的蓝藻（或者称“蓝细菌”）同样含有叶绿素，和叶绿体一样进行产氧光合作用。 事实上，目前普遍认为叶绿体是由蓝藻进化而来的。 其它光合细菌具有多种多样的色素，称作细菌叶绿素或菌绿素，但不氧化水生成氧气，而以其它物质（如硫化氢、硫或氢气）作为电子供体。 不产氧光合细菌包括紫硫细菌、紫非硫细菌、绿硫细菌、绿非硫细菌和太阳杆菌等。 [编辑本段]5. 影响光合作用的外界条件5.1 光照光合作用是一个光生物化学反应，所以光合速率随着光照强度的增加而加快。 但超过一定范围之后，光合速率的增加变慢，直到不再增加。 光合速率可以用CO2的吸收量来表示，CO2的吸收量越大，表示光合速率越快。 5.2 二氧化碳CO2是绿色植物光合作用的原料，它的浓度高低影响了光合作用暗反应的进行。 在一定范围内提高CO2的浓度能提高光合作用的速率，CO2浓度达到一定值之后光合作用速率不再增加，这是因为光反应的产物有限。 5.3 温度温度对光合作用的影响较为复杂。 由于光合作用包括光反应和暗反应两个部分，光反应主要涉及光物理和光化学反应过程，尤其是与光有直接关系的步骤，不包括酶促反应，因此光反应部分受温度的影响小，甚至不受温度影响；而暗反应是一系列酶促反应，明显地受温度变化影响和制约。 当温高于光合作用的最适温度时，光合速率明显地表现出随温度年升而下降，这是由于高温引起催化暗反应的有关酶钝化、变性甚至遭到破坏，同时高温还会导致叶绿体结构发生变化和受损；高温加剧植物的呼吸作用，而且使二氧化碳溶解度的下降超过氧溶解度的下降，结果利于光呼吸而不利于光合作用；在高温下，叶子的蒸腾速率增高，叶子失水严重，造成气孔关闭，使二氧化碳供应不足，这些因素的共同作用，必然导致光合速率急剧下降。 当温度上升到热限温度，净光合速率便降为零，如果温度继续上升，叶片会因严重失水而萎蔫，甚至干枯死亡。 5.4 矿质元素矿质元素直接或间接影响光合作用。 例如，N是构成叶绿素、酶、ATP的化合物的元素，P是构成ATP的元素，Mg是构成叶绿素的元素。 5.5 水分水分既是光合作用的原料之一，又可影响叶片气孔的开闭，间接影响CO2的吸收。 缺乏水时会使光合速率下降。 [编辑本段]6. 光合作用的进化过程 光合作用不是起源于植物和海藻，而是起源于细菌。 从这些进程中能够很明显地看出，无论是宿主生物体，还是共生细胞，它们都在光合作用。 此“半植半兽”微生物在宿主和共生体细胞之间的快速转变可能在光合作用演化过程中起过关键作用，推动了植物和海藻的进化。 虽然目前科学家还不能培养野生Hatena来完全研究清楚他的生命周期，但是这一阶段的研究可能会为搞清楚什么使得叶绿体成为细胞永久的一部分提供了一些线索。 科学家认为，此生命现象导致海藻进化出一种吞噬细菌的方法，最终使海藻进化出自己的叶绿体来进行光合作用。 然而，这一过程到底是怎样发生的，目前还是一个不解之谜。 从此研究发现可以看出，光合作用不是起源于植物和海藻，而是最先发生在细菌中。 正是因为细菌的有氧光合作用演化造成地球大气层中氧气含量的增加，从而导致复杂生命的繁衍达十亿年之久。 在其他的实验中，冈本和井上教授尝试了喂给Hatena其他的海藻，想看看它是否会有同样的反应。 但是，尽管它也吞噬了海藻，却没有任何改变的过程。 这说明在这两者之间存在着某种特殊的关系。 判断出这种关系是否是基因决定的将是科学家需要解决的下一个难题。 光合作用的基因可能同源，但演化并非是一条从简至繁的直线科学家罗伯持·布来肯细普曾在《科学》杂志上发表报告说，我们知道这个光合作用演化来自大约25亿年前的细菌，但光合作用发展史非常不好追踪，且光合微生物的多样性令人迷惑，虽然有一些线索可以将它们联系在一起，但还是不清楚它们之间的关系。 为此，布来肯细普等人通过分析五种细菌的基因组来解决部分的问题。 他们的结果显示，光合作用的演化并非是一条从简至繁的直线，而是不同的演化路线的合并，靠的是基因的水平转移，即从一个物种转移到另一个物种上。 通过基因在不同物种间的“旅行”从而使光合作用从细菌传到了海藻，再到植物。 布来肯细普写道：“我们发现这些生物的光合作用相关基因并没有相同的演化路径，这显然是水平基因转移的证据。 ”他们利用BLAST检验了五种细菌：蓝绿藻、绿丝菌、绿硫菌、古生菌和螺旋菌的基因，结果发现它们有188个基因相似，而且，其中还有约50个与光合作用有关。 它们虽然是不同的细菌，但其光合作用系统相当雷同，他们猜测光合作用相关基因一定是同源的。 但是否就是来自Hatena，还有待证实。 然而，光合作用的演化过程如何？为找到此答案，布来肯细普领导的研究小组利用数学方法进行亲缘关系分析，来看看这5种细菌的共同基因的演化关系，以决定出最佳的演化树，结果他们测不同的基因就得出不同的结果，一共支持15种排列方式。 显然，它们有不同的演化史。 他们比较了光合作用细菌的共同基因和其它已知基因组的细菌，发现只有少数同源基因堪称独特。 大多数的共同基因可能对大多数细菌而言是“日常”基因。 它们可能参加非光合细菌的代谢反应，然后才被收纳成为光合系统的一部分。 [编辑本段]7. 光合作用的发现历程 7.1 发现年表公元前，古希腊哲学家亚里士多德认为：植物生长所需的物质全来源于土中。 1627年，荷兰人范·埃尔蒙做了盆栽柳树称重实验，得出植物的重量主要不是来自土壤而是来自水的推论。 他没有认识到空气中的物质参与了有机物的形成。 1771年，英国的普里斯特利发现植物可以恢复因蜡烛燃烧而变“坏”了的空气。 他做了一个有名的实验，他把一支点燃的蜡烛和一只小白鼠分别放到密闭的玻璃罩里，蜡烛不久就熄灭了，小白鼠很快也死了。 接着，他把一盆植物和一支点燃的蜡烛一同放到一个密闭的玻璃罩里，他发现植物能够长时间地活着，蜡烛也没有熄灭。 他又把一盆植物和一只小白鼠一同放到一个密闭的玻璃罩里。 他发现植物和小白鼠都能够正常地活着，于是，他得出了：植物能够更新由于蜡烛燃烧或动物呼吸而变得污浊了的空气。 但他并没有发现光的重要性。 1779年，荷兰的英恩豪斯证明只有植物的绿色部分在光下才能起使空气变“好”的作用。 1804年，法国的索叙尔通过定量研究进一步证实二氧化碳和水是植物生长的原料。 1845年，德国的迈尔发现植物把太阳能转化成了化学能。 1864年，德国的萨克斯发现光合作用产生淀粉。 他做了一个试验：把绿色植物叶片放在暗处几个小时，目的是让叶片中的营养物质消耗掉，然后把这个叶片一半曝光，一半遮光。 过一段时间后，用典蒸汽处理发现遮光的部分没有发生颜色的变化，曝光的那一半叶片则呈深蓝色。 这一实验成功的证明绿色叶片在光和作用中产生淀粉。 1880年，美国的恩格尔曼发现叶绿体是进行光合作用的场所，氧是由叶绿体释放出来的。 他把载有水绵（水绵的叶绿体是条 水绵状，螺旋盘绕在细胞内）和好氧细菌的临时装片放在没有空气的暗环境里，然后用极细光束照射水绵通过显微镜观察发现，好氧细菌向叶绿体被光照的部位集中：如果上述临时装片完全暴露在光下，好氧细菌则分布在叶绿体所有受光部位的周围。 1897年，首次在教科书中称它为光合作用。 20世纪30年代，美国科学家鲁宾和卡门采用同位素标记法研究了“光合作用中释放出的氧到底来自水，还是来自二氧化碳”这个问题，得到了氧气全部来自于水的。 20世纪40年代，美国的卡尔文等科学家用小球藻做实验：用C14标记的二氧化碳（其中碳为C14）供小球藻进行光合作用，然后追踪检测其放射性，最终探明了二氧化碳中的碳在光合作用中转化成有机物中碳的途径，这一途径被成为卡尔文循环。 直到18世纪中期，人们一直以为植物体内的全部营养物质，都是从土壤中获得的，并不认为植物体能够从空气中得到什么。 1771年，英国科学家普利斯特利发现，将点燃的蜡烛与绿色植物一起放在一个密闭的玻璃罩内，蜡烛不容易熄灭；将小鼠与绿色植物一起放在玻璃罩内，小鼠也不容易窒息而死。 因此，他指出植物可以更新空气。 但是，他并不知道植物更新了空气中的哪种成分，也没有发现光在这个过程中所起的关键作用。 后来，经过许多科学家的实验，才逐渐发现光合作用的场所、条件、原料和产物。 1864年，德国科学家萨克斯做了这样一个实验：把绿色叶片放在暗处几小时，目的是让叶片中的营养物质消耗掉。 然后把这个叶片一半曝光，另一半遮光。 过一段时间后，用碘蒸气处理叶片，发现遮光的那一半叶片没有发生颜色变化，曝光的那一半叶片则呈深蓝色。 这一实验成功地证明了绿色叶片在光合作用中产生了淀粉。 1880年，德国科学家恩吉尔曼用水绵进行了光合作用的实验：把载有水绵和好氧细菌的临时装片放在没有空气并且是黑暗的环境里，然后用极细的光束照射水绵。 通过显微镜观察发现，好氧细菌只集中在叶绿体被光束照射到的部位附近；如果上述临时装片完全暴露在光下，好氧细菌则集中在叶绿体所有受光部位的周围。 恩吉尔曼的实验证明：氧是由叶绿体释放出来的，叶绿体是绿色植物进行光合作用的场所。 [编辑本段]8. 光合作用原理的研究与应用研究光合作用，对农业生产，环保等领域起着基础指导的作用。 知道光反应暗反应的影响因素，可以趋利避害，如建造温室，加快空气流通，以使农作物增产。 人们又了解到二磷酸核酮糖羧化酶的两面性，即既催化光合作用，又会推动光呼吸，正在尝试对其进行改造，减少后者，避免有机物和能量的消耗，提高农作物的产量。 当了解到光合作用与植物呼吸的关系后，人们就可以更好的布置家居植物摆设。 比如晚上就不应把植物放到室内，以避免因植物呼吸而引起室内氧气浓度降低。 农业生产的目的是为了以较少的投入，获得较高的产量。 根据光合作用的原理，改变光合作用的某些条件，提高光合作用强度（指植物在单位时间内通过光合作用制造糖的数量），是增加农作物产量的主要措施。 这些条件主要是指光照强度、温度、CO2浓度等。 如何调控环境因素来最大限度的增加光合作用强度，是现代农业的一个重大课题。 [编辑本段]9. 我国提高光合作用效率的实例云南生态农业研究所所长那中元开发的作物基因表型诱导调控表达技术（GPIT），在世界上第一个成功地解决了提高光合作用效率的难题。 提高农作物产量有多种途径，其中之一是提高作物光合作用效率，而如何提高则是一个世界难题，许多发达国家开展了多年研究，但至今未见成功的报道。 那中元开发的GPIT技术率先解决了这一难题，据西藏、云南、山东、黑龙江、吉林等省、自治区试验结果，使用GPIT技术，不同作物的光合作用效率可分别提高50%至400%以上。 云南省西北部的迪庆藏族自治州中甸高原坝区海拔3276米，玉米全生育期有效积温493℃，不到世界公认有效积温最低极限的一半；玉米苗期最低气温零下5.4℃，地表最低气温零下9.5℃。 但使用GPIT技术试种的玉米仍生长良好，获得每亩499公斤的高产。 1999年在海拔3658米的拉萨试种的玉米，单株最多长出八穗，全部成熟，且全是高赖氨酸优质玉米。 全国高海拔地区和寒冷地区的试验示范表明，应用GPIT技术可使作物的生育期大为缩短，小麦平均缩短7至15天，水稻平均缩短10至20天，玉米平均缩短30至40天。 GPIT技术还解决了农作物自身抗性表达，高抗根、茎、叶多种病害的世纪难题。 1999年在昆明市官渡区进行了百亩小麦连片对照试验，未使用GPIT技术的小麦三次施用农药，白粉病仍很严重；而应用GPIT技术处理的百亩小麦，不用农药，基本不见病株。 [编辑本段]10. 光合作用的简单实验【设计】 光合作用是绿色植物在光下把二氧化碳和水合成有机物（淀粉等），同时放出氧气的过程。 本实验应用对比的方法，使学生认识：（1）绿叶能制造淀粉；（2）绿叶必须在光的作用下才能制造出淀粉。 火。 光合作用是指绿色植物通过叶绿体，利用光能，把二氧化碳和水转化成储存着能量的有机物，并且释放出氧的过程。 我们每时每刻都在吸入光合作用释放的氧。 我们每天吃的食物，也都直接或间接地来自光合作用制造的有机物。 那么，光合作用是怎样发现的呢？

网上的生物信息学资源都有哪些

生物信息资源简介生物信息（bioinformatics）中的“信息（-informatics）”指的是从海量的数据中进行挖掘，从而得到知识的过程，如下图所示。 在这个过程中，会涉及到数据的管理，数据的运算，数据挖掘和建模仿真。 其中，数据管理部分主要是数据库（database），数据的运算部分主要是指各种生物信息的软件（software tools）。 这两部分是生物信息研究非常重要的资源，也是生信入门需要了解的基础知识。 下面简要介绍一下这些资源。 （本文根据北京大学生物信息学公开课程视频整理，图片来自视频截图）根据不同的特点，可以把这些资源分成不同的类别。 比如根据数据性质可以将database分为原始数据（Original data）数据库和二级数据（Secondary data）数据库。 再比如根据软件是独立的工具还是网络服务器，可以将software tools分为standalone programs和web servers。 根据发布者的类别可以分为centralized resources和individual resources。 比较大的centralized resources主要有NCBI（National Center for Biotechnology Information）， EBI（European Bioinformatics Institute）和UCSC（University of California Santa Cruz）Genome Browser。 下面将分别介绍这三个最大的数据库以及其他的生物信息学数据资源。 1．NCBI简介NCBI-Genome Database：存储了目前绝大多数的被测序出来的基因组，目前有1000+基因组被测序出来。 NCBI-Nucleotide/protein (RefSeq):将不同的版本作了整合之后的参考序列。 其中NM_*表示核酸序列，NP_*表示蛋白序列。 其中核酸给出了ID号，名称，物种，特征，编码区，序列等信息。 蛋白还给出了功能区间信息。 NCBI-Gene：以基因为单位，整合了pathway、variations、phenotype等信息。 对于Human genes而言，GeneCards比NCBI有更好的对人类基因、蛋白的注释（表达、相互作用、同源蛋白、功能、遗传变异等）。 NCBI-SRA新一代测序技术的短序列database，每5个月数据就会翻倍。 NCBI-Taxonomy把所有至少有一个基因被测序过的物种做的物种分类树，在所有被描述过的物种中有10%被测序过。 NCBI-PubMed用于查阅文献。 NCBI-MeSH（Medical Subject Heading）controlled vocabulary used for indexing articles for PubMed 结构化的词库。 NCBI-My NCBI对于感兴趣的关键词，在NBCI设定之后，每周会推送相关文献，对于项目中跟踪文献非常有用。 NCBI-BLASTNCBI最著名的工具，关于BLAST的两篇文章已经被引用了四万两千多次。 不同版本的BLAST包括：Online：NCBI-BLASTStandalone：BLAST+Embedded in webpage：wwwblast2. EBI简介EBI中的一些资源如表中所示：EBI-Ensembl：介于NCBI和UCSC之间的资源，整合很多物种的不同的资源。 Ensembl中数量的类型包括：EBI-UniProtKBThe Universal Protein Resource (UniProt) is a comprehensive resource for protein sequence and annotation data.（The UniProt Knowledgebase (UniProtKB) is the central hub for the collection of functional information on proteins, with accurate, consistent and rich annotation. ）UniProtKB -Swiss-Prot（已经过人工校对）UniProtKB -TrEMBL（无人工校对）EBI-IntAct分子之间相互作用EBI-Clustal Omega多序列比对EBI-InterProScan输入一个序列，看是否包含目前已经知道功能的蛋白的区域3 UCSC简介以基因组为坐标。 包含很多的track，包括：SNP，mRNA，剪切的EST，没剪切的EST，高通量的，通过Chi